（6/27 20：30 現在 東京都災害対策本部発表）
| 避難所 | 避難者数 | 職員数 |
| 三宅小学校（阿古地区住民） | 779名 | 49名 |
| 三宅中学校（坪田地区住民） | 517名 | |
| 三宅保育園（伊ヶ谷地区住民） | 176名 | 5名 |
| 神着老人福祉会館（三池地区住民） | 36名 | 2名 |
| 勤労福祉会館 （特養ホームあじさいの里入所者含む） |
232名 | 19名 |
| 湯ノ浜漁港（阿古地区住民） | 50名 | |
| 計 | 1790名 | 75名 |
※※職員等には、消防団、警察を含まない。
島外自主避難者数 |
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| 島外に避難した住民 | 260名 |
| 観光客等 | 122名 |
計 |
382名 |
合計 2172名＋職員75名